Заслужений лікар РФ, доктор медичних наук, професор.
У 1985 році закінчив з відзнакою Московський Медичний Стоматологічний інститут ім. Н. А. Семашко.
У 1993 році захистив дисертацію на здобуття наукового ступеня кандидата медичних наук за темою: «Оптимізація та клініко-лабораторне обгрунтування абляційних режимів імпульсно-періодичної СО-лазерної установки при операціях на щелепних костях і органах порожнини рота».
У 2001 році захистив дисертацію на здобуття учений ступеня доктора медичних наук за темою: «Принципи прогнозування та профілактики ускладнень при дентальної імплантації (клініко-лабораторні дослідження)».
Під його керівництвом захищені 14 кандидатських і 2 докторські дисертації, а також затверджені і виконуються кандидатські і докторські дисертації в галузі стоматологічної імплантології, судової стоматології, реконструктивної пародонтологии і одонтосохраняющім біотехнологій. За останні роки Базікяном Е. А. внесений значний внесок у розробку методів по дентальної імплантації, одонтосохраняющім і клітинним технологіям. Розроблені ним методи впроваджені в практичну діяльність кафедр Московського медико-стоматологічного університету (МДМСУ) і ряду стоматологічних навчальних і лікувальних установ країни і міста Москви.
З 2003 року Базикян Е. А. призначений завідувачем відділу аспірантури і докторантури МДМСУ, а з 2004 року він очолив кафедру пропедевтичної стоматології МДМСУ.
З 2007 року професор Базикян Ернест Арамович працював на посаді проректора з навчальної роботи та стратегічного розвитку МДМСУ.
У 2009 році йому присвоєно звання Заслуженого лікаря РФ. Педагог вищої школи 2012 року.
Автор 250 статей, 8 патентів, у тому числі 3-х підручників з пропедевтичного стоматології, 23-х навчальних посібників, 2-х монографій і атласів для медичного інструментарію.
